二套房屋契税是根据房屋建筑面积来计算的，契税的税率一般是在百分之至百分之三。

房屋契税申报的时间是房屋权属转移合同的当天，或者纳税人取得其他具有土地凭证的当天。

　　一、二套房屋契税怎么算的

二套房屋契税的计算如下：

1.面积小于90平米买方首套房子契税：评估价格的1%

2.面积大于90小于144平米买方首套契税为：评估价格的1.5%

3.高于该区的市场指导价格，面积大于或等于144平米，买方不是首套房，则二套房契税或二套以上房产契税：评估价格的3%。

税费:买方税:契税按总价1.5%。

卖方税:个税1%,房产证满5年且是业主唯一住宅免交。

房产证满5年免交。

双方税:印花税按总价万分之一,其它手续费数百。

以上税费通常都由买方出。

　　二、减征或者免征的契税情形

有下列情形之一的，减征或者免征契税：

1.国家机关、事业单位、社会团体、军事单位承受土地、房屋用于办公、教学、医疗、科研和军事设施的，免征;

2.城镇职工按规定第一次购买公有住房的，免征;

3.因不可抗力灭失住房而重新购买住房的，酌情准予减征或者免征;

4.财政部规定的其他减征、免征契税的项目。

　　三、房产契税滞纳金怎么算

房产契税的滞纳金是按日加收滞纳税款的万分之五。

纳税人未按照规定缴纳房产契税的房地产登记部门无法核发产权登记证书、无法提取住房公积金、无法办理户口，同时由税务机关除责令限期缴纳，并加收滞纳金。

法律依据：

《契税法》第九条　

契税的纳税义务发生时间，为纳税人签订土地、房屋权属转移合同的当日，或者纳税人取得其他具有土地、房屋权属转移合同性质凭证的当日。

《税收征收管理法》第三十二条

纳税人未按照规定期限缴纳税款的，扣缴义务人未按照规定期限解缴税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。