细菌出现在很早以前的原始海洋，它的祖先是一类厌氧的、需要依赖别的细胞提供营养才能生存的原始生命，经过漫长的演化过程，才具有了细胞的形态。

尽管这是一个质的飞跃，但这类细菌仍然可在厌氧条件下生活。

随着地球环境的变化和生物的进化，海洋里产生了一些释放氧气的藻类，有些细菌也变成了有氧呼吸的类型，地球上氧气增加导致需氧生物种类增多，并成为地球上生物的主体。

但一些细菌仍然保留着厌氧的生活习性，继续发挥着它们特殊的作用。