茎突过长会引发咽部疼痛，主要区域包括扁桃体、舌根部，常为单侧，一般并不剧烈。但是严重时可以放射到耳部或者颈部，有时在吞咽、讲话、转头或夜间加重。同时也会出现咽部异物感或梗阻感，也是单侧多见，有的时候有针刺感、紧缩感、牵拉感等。吞咽的时候更加明显，过长的茎突还会引发颈动脉压迫的症状，疼痛或不适的感觉向上会放射至头顶部或眼部，向外侧会放射至同侧的面部。除这些常见的症状之外，有时也会引发耳鸣、流口水、失眠等神经衰弱的表现。有些患者也会以咳嗽为主前来就诊。